Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A3Q9NQ40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A3Q9NQ40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms