Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4BQ9NPR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4BQ9NPR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms