Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CABP2Q9NPB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CABP2Q9NPB3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP2Q9NPB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP2Q9NPB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms