Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLMQ9NP87 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLMQ9NP87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLMQ9NP87 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms