Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM27Q9HBJ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms