Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFCAB1Q9HAE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB1Q9HAE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB1Q9HAE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms