Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
VRTNQ9H8Y1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VRTNQ9H8Y1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VRTNQ9H8Y1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VRTNQ9H8Y1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VRTNQ9H8Y1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VRTNQ9H8Y1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms