Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF1Q9H7N4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF1Q9H7N4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SCAF1Q9H7N4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms