Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPF2Q9H7B2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPF2Q9H7B2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms