Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
REEP4Q9H6H4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REEP4Q9H6H4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms