Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP2Q9H5N1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP2Q9H5N1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms