Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM12Q9H4Q4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM12Q9H4Q4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms