Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIBC2Q9H4K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIBC2Q9H4K1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms