Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZHX3Q9H4I2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZHX3Q9H4I2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZHX3Q9H4I2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZHX3Q9H4I2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZHX3Q9H4I2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZHX3Q9H4I2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms