Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S7

PTPN23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN23Q9H3S7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPN23Q9H3S7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPN23Q9H3S7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPN23Q9H3S7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPN23Q9H3S7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPN23Q9H3S7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPN23Q9H3S7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPN23Q9H3S7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPN23Q9H3S7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms