Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF3Q9H094 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF3Q9H094 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms