Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A8Q9C0K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A8Q9C0K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A8Q9C0K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A8Q9C0K1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms