Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP2Q9C0E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP2Q9C0E4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP2Q9C0E4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP2Q9C0E4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP2Q9C0E4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms