Protein–RNA interactions for Protein: Q9C091

GREB1L, GREB1-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1LQ9C091 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GREB1LQ9C091 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREB1LQ9C091 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1LQ9C091 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms