Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFIH1Q9BYX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFIH1Q9BYX4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFIH1Q9BYX4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms