Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTRT3Q9BYD9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms