Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCAR1Q9BXC0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCAR1Q9BXC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms