Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC94Q9BW85 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC94Q9BW85 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC94Q9BW85 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms