Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3CQ9BUI4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3CQ9BUI4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3CQ9BUI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms