Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms