Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFJQ9BTM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms