Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCMBPQ9BTE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCMBPQ9BTE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCMBPQ9BTE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms