Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT11Q9BT88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT11Q9BT88 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT11Q9BT88 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms