Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms