Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDFIP1Q9BT67 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDFIP1Q9BT67 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDFIP1Q9BT67 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms