Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCHR1Q99705 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCHR1Q99705 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCHR1Q99705 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms