Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITX2Q99697 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms