Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MEIS3Q99687 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEIS3Q99687 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEIS3Q99687 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms