Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RMDN3Q96TC7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RMDN3Q96TC7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RMDN3Q96TC7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN3Q96TC7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms