Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SECISBP2Q96T21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms