Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms