Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC9Q96Q05 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms