Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSSK3Q96PN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK3Q96PN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSSK3Q96PN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TSSK3Q96PN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK3Q96PN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK3Q96PN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms