Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1Q96NA8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms