Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RILPQ96NA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms