Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF396Q96N95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF396Q96N95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF396Q96N95 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms