Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms