Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNH8Q96L42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNH8Q96L42 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNH8Q96L42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNH8Q96L42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KCNH8Q96L42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNH8Q96L42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNH8Q96L42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms