Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD3Q96L08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD3Q96L08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD3Q96L08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms