Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCPIP1Q96JH7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms