Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP3Q96JB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms