Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG1Q96JA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRIG1Q96JA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIG1Q96JA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms