Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF6Q96J87 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CELF6Q96J87 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CELF6Q96J87 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms