Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJA3Q96EY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAJA3Q96EY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA3Q96EY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms