Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM19Q96E16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM19Q96E16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms