Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM5Q96DZ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM5Q96DZ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM5Q96DZ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms